Durante a década de 90, foi observado em vários centros europeus e norte-americanos de cancer, um aumento na incidência de cancer anal em homens jovens HIV-soropositivos anorreceptivos, em comparação com a população em geral, principalmente após a introdução da TARV, refletindo o impacto da coinfecção com HIV e HPV na história natural da neoplasia intraepitelial anal e subsequente desenvolvimento no carcinoma anal. Alterações citológicas do epitélio anal induzidas pelo HPV podem ser detectadas por rastreio citológico assim como é feito no rastreio do cancer de colo de útero. Mesmo a carcinogenese anal ainda não ser bem conhecida, a citologia anorretal vem sendo utilizada como um teste de rastreio útil para detecção de lesões precursoras que podem ser erradicadas reduzindo potencialmente a incidência do câncer anal, principalmente em pacientes masculinos com HIV.