A finales del siglo XVI, un embaucador, nigromante y prófugo de la justicia, que se hace pasar por un experto alquimista consigue que el emperador Rodolfo II adquiera, por un precio elevadísimo, un misterioso manuscrito cuya autoría atribuye a un monje medieval. A la muerte del emperador, el manuscrito, que nadie consigue descifrar, pasa por diversos propietarios, perdiéndose su pista hasta que tres siglos más tarde alguien encarga a Voynich, un oscuro y viejo librero con fama de falsificador, y a su socio, un enigmático espía que se hace llamar Sydney Reilly, que encuentren y consigan a cualquier precio el misterioso libro. Pero el destino impide que el encargo se cumpla por completo y el librero se encuentra con un sorprendente manuscrito, cuyo origen no puede explicar, y que se convierte en el centro de atención de investigadores, criptógrafos y expertos de todo tipo, que tratan de hallar la clave con la que descifrar el incomprensible lenguaje y los desconcertantes dibujos que aparecen en sus páginas.